MindSpore SPONGE

MindSpore SPONGE是一款基于MindSpore的计算生物领域套件,支持分子动力学、蛋白质折叠等常用功能,将分子模拟与AI训练/推理统一到同一套编程架构下。

MindSpore SPONGE

一句话定位

基于MindSpore的计算生物领域AI套件,统一分子模拟与AI训练/推理的编程框架。

核心价值

  • 将分子模拟与AI训练/推理统一到同一套编程架构下,简化复杂生物计算流程
  • 支持自动微分技术,取代手动的导数编程,为不同能量函数提供统一编程范式
  • 完全兼容神经网络模型,支持分子模拟内的AI推理或模拟作为引擎的AI训练

功能亮点

  • 分子动力学模拟:支持蛋白质折叠、分子对接等生物计算功能
  • 自动微分技术:为复杂打分函数提供统一编程范式
  • 多后端适配:支持GPU、NPU等多种硬件平台加速执行
  • 端到端可微:实现物理模型的元优化
  • 自动并行支持:支持高通量模拟,无需特殊MPI编程

适用人群

  • 生物计算研究人员和科学家
  • 药物发现和分子设计工程师
  • AI+科学计算开发者
  • 蛋白质结构预测研究者
  • 分子动力学模拟用户

使用场景

  • 基于AI改进力场或增强抽样的分子模拟
  • 数据驱动+物理驱动的分子对接
  • 蛋白质结构的预测与力场优化
  • 高通量的分子模拟
  • 分子设计和药物发现

综合说明

MindSpore SPONGE是一个专门为计算生物领域设计的AI套件,通过将分子模拟与AI训练/推理统一到MindSpore框架下,为生物计算研究提供了高效、易用的解决方案。它特别适合需要进行分子动力学模拟、蛋白质折叠研究、药物分子设计等复杂生物计算的科研人员和开发者使用。